微生物實驗室主要是對微生物的分離、培養(yǎng)、育種、鑒別、形態(tài)、變異、利用、危害等方面進行實驗和研究，食品微生物實驗室主要檢測項目有：酵母、乳酸菌、雙歧桿菌、罐頭商業(yè)無菌、菌落總數(shù)、大腸菌群、霉菌、致病菌（如沙門氏菌、志賀氏菌、溶血性鏈球菌、金黃色葡萄球菌等），應(yīng)該將實驗室建在遠離生活區(qū)，清潔安靜的場所；要與生產(chǎn)加工車間較近的距離，方便扦樣與檢驗。

實驗室墻壁、天花板和地板光滑、易清潔、防滲漏并耐化學品和劑的腐蝕；實驗臺面防水，并可耐劑、酸、堿、有機溶劑和中等熱度。 整個實驗室通過科學設(shè)計，精心施工，使實驗室內(nèi)形成堅固、無縫、平滑、美觀、不反光、不積塵、不生銹、防潮、、性能優(yōu)良的無菌表面和內(nèi)殼。

必須安裝獨立的通風空調(diào)系統(tǒng)以控制實驗室氣流方向和壓強梯度。該系統(tǒng)必須確保實驗室使用時，室內(nèi)空氣除通過排風管道經(jīng)過濾排出外，不得從實驗室的其他部位或縫隙排向室外；同時確保實驗室內(nèi)的氣流由“清潔”區(qū)域流向“污染”區(qū)域。進風口和排風口的布局應(yīng)使實驗區(qū)內(nèi)的死空間降低到zui小程度。

通風空調(diào)系統(tǒng)為直排系統(tǒng)，不得采用部分回風系統(tǒng)。實驗室的進風應(yīng)經(jīng)初、中、三級過濾。

實驗室的排風必須經(jīng)過濾或加其他方法處理后，以不低于12m/s的速度直接向空中排放。該排風口應(yīng)遠離系統(tǒng)進風口位置。處理后的排風也可排入建筑物的排風管道，但不得被送回到該建筑物的任何部位。