財務軟件需要到財政局備案方可使用，有的代理記賬單位沒有采用財政部批準的財務軟件來替代手工記賬。

會計資料交接麻煩、不夠規(guī)范。代理記賬單位在接受委托單位的會計原始憑證及資料時，沒有辦理交接手續(xù)，發(fā)現(xiàn)遺失或毀損時無法查找。

代理記賬單位通常是定期或定時上門服務，日常業(yè)務可通過電話溝通，會計不是隨時在單位辦理和咨詢業(yè)務

代理記賬機構，是指依法經(jīng)批準設立從事代理記賬業(yè)務的中介機構。

代理記賬機構主要包括代理記賬公司、會計師事務所、稅務師事務所以及具有代理記賬資格的其他社會咨詢服務機構等幾大類。代理記賬機構從事代理記賬業(yè)務必須符合財政部發(fā)布的《代理記賬管理暫行辦法》中的關于從事代理記賬業(yè)務應具備條件的規(guī)定。

代理記賬的內(nèi)容主要是代替獨立核算單位辦理記賬、算賬、報賬等業(yè)務；代理記賬的性質(zhì)是一種社會性會計服務活動，是會計工作社會化、專門化的表現(xiàn)；代理記賬在法律上的表現(xiàn)則是通過簽訂委托合同的方式來明確和規(guī)范委托及受托雙方的權利義務關系。

納稅人稅務登記內(nèi)容發(fā)生變化的，應當自工商行政管理機關或者其他機關辦理變更登記之日起30日內(nèi)，持有關證件向原稅務登記機關申報辦理變更稅務登記；納稅人稅務登記內(nèi)容發(fā)生變化，不需要到工商行政管理機關或者其他機關辦理變更登記的，應當自發(fā)生變化之日起30日內(nèi)，持有關證件向原稅務登記機關申報辦理變更稅務登記。