高新技術企業(yè)認定專項審計，是指注冊會計師接受擬向有關部門申請進行高新技術企業(yè)認定的申報企業(yè)委托，對其近三個會計年度(實際經營不滿三年的按實際經營年限)的研究開發(fā)費用結構明細表和近一個會計年度的高新技術產品(服務)收入明細表進行審計，并出具專項審計報告。

高新技術企業(yè)是指在《國家重點支持的高新技術領域》內，持續(xù)進行研究開發(fā)與技術成果轉化，形成企業(yè)核心自主知識產權，并以此為基礎開展經營活動，在中國境內(不包括港、澳、臺地區(qū))注冊一年以上的居民企業(yè)。它是知識密集、技術密集的經濟實體。

高新技術企業(yè)專項審計，是依據高新技術企業(yè)認定辦法相關規(guī)定，對近三年的研發(fā)費用支出情況及高新技術產品（服務）收入情況進行審計，出具審計專項報告。該報告主要用于企業(yè)申辦高新技術企業(yè)或高新技術企業(yè)復審使用。提供給科委、財政、稅務、工商單位及管理層和董事會等相關。

申報明細表又區(qū)別于年度財務報表。企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用結構明細表和近一年高新技術產品(服務)收入明細表是按照《高新技術企業(yè)認定管理辦法》和《高新技術企業(yè)認定管理工作指引》編制的，其列報的數據可以直接反映出企業(yè)是否滿足認定條件。