高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定審計肯定是在高新技術(shù)企業(yè)的基礎(chǔ)上才能去操作的，所以，想要申報高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定審計，首先需要認(rèn)定企業(yè)為高新技術(shù)企業(yè)。一定要先認(rèn)定為高新技術(shù)企業(yè)，才能申報高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定審計。

高新技術(shù)企業(yè)專項審計，是依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，對近三年的研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入情況進(jìn)行審計，出具審計專項報告。該報告主要用于企業(yè)申辦高新技術(shù)企業(yè)或高新技術(shù)企業(yè)復(fù)審使用。提供給科委、財政、稅務(wù)、工商單位及管理層和董事會等相關(guān)。

無論是研究開發(fā)費(fèi)用，還是高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))，在專項審計中都涉及高新技術(shù)的識別。注冊會計師不是高新技術(shù)領(lǐng)域的專家，《專項審計指引》為此做了如下規(guī)定：

(1)恰當(dāng)界定研究開發(fā)項目、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))的具體范圍是申報企業(yè)的責(zé)任。

(2)申報企業(yè)技術(shù)負(fù)責(zé)人與企業(yè)法定代表人、財務(wù)負(fù)責(zé)人共同簽署《管理當(dāng)局聲明書》。

但《專項審計指引》也規(guī)定，制定總體審計策略時，應(yīng)當(dāng)清楚地說明向具體審計領(lǐng)域調(diào)配的資源，包括就復(fù)雜的研究開發(fā)項目技術(shù)問題利用專家的工作。

高新審計依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定辦法相關(guān)規(guī)定，企業(yè)申請高新認(rèn)定，需要對近三年的財務(wù)狀況、研發(fā)費(fèi)用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入情況進(jìn)行審計，出具審計專項報告和年度審計報告。

會計師會結(jié)合企業(yè)情況，給出一份準(zhǔn)備材料的清單。主要是企業(yè)的資產(chǎn)負(fù)債表、損益表、總賬、明細(xì)賬、科目余額表(到末級科目)、財務(wù)憑證、公司的執(zhí)照、章程等等。