據醫(yī)院官網2015年12月信息顯示，醫(yī)院設置165個臨床、醫(yī)技科室，233個護理單元，擁有8個國家重點學科、1個國家重點實驗室、20個省部級及全軍重點實驗室、33個全軍醫(yī)學專科中心和研究所，形成了以綜合診療為特色的13項專業(yè)優(yōu)勢。同時是全軍重癥監(jiān)護示范基地和中華護理學會的培訓基地。設有國際醫(yī)學中心和健康醫(yī)學中心，提供高端預防保健服務。醫(yī)院年門急診量490余萬人，收容19.8萬人，手術近9萬例。

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中心主任簡介：

王福生，男，中國科學院院士、主任醫(yī)師。國家感染性疾病臨床醫(yī)學研究中心主任，解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學中心感染病診療與研究中心主任，全軍傳染病研究所所長。國家杰出青年基金獲得者、國家973（肝?。╉椖渴紫茖W家、國家自然科學基金創(chuàng)新研究群體牽頭人。

國家耳鼻咽喉疾病臨床醫(yī)學研究中心，依托中國人民解放軍總醫(yī)院，于2019年5月由科技部、國家衛(wèi)生健康委、軍委后勤保障部和國家藥監(jiān)局正式批準成立，也是認定的國家耳鼻咽喉疾病臨床醫(yī)學研究中心，中心主任為楊仕明教授。