北京同仁醫(yī)院擁有教育部重點實驗室1個，工信部重點實驗室1個，北京市重點實驗室5個;工程研究中心1個，省部級工程研究中心4個;省部級國家科技合作基地2個，北京實驗室1個。醫(yī)院是全國防盲技術(shù)指導(dǎo)組和防聾治聾技術(shù)指導(dǎo)組組長單位，設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，作為國際眼庫協(xié)會會員單位，設(shè)有北京同仁眼庫。

北京同仁醫(yī)院擁有中國工程院院士1名，國家萬人計劃4人，長江學(xué)者1名，百千萬工程人選9人，國家杰出青年基金獲得者2名，國家青年基金獲得者1名，享受政府特殊津貼專家11名，榮獲省部級突出貢獻專家15人，北京學(xué)者4名，青年北京學(xué)者2名，萬人計劃教學(xué)名師1人。

北京同仁醫(yī)院作為首都醫(yī)科大學(xué)第四臨床醫(yī)學(xué)院，醫(yī)院承擔(dān)著重要的教學(xué)任務(wù);首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在醫(yī)院內(nèi)。醫(yī)院現(xiàn)有研究生學(xué)位點28個，其中博士學(xué)位點13個;碩士研究生導(dǎo)師163名，其中博士研究生導(dǎo)師67名，國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)專業(yè)基地16個。2012年以來，醫(yī)院獲批項目(課題)243項，獲省部級及以上(含社會力量獎)31項，其中國家獎3項。

北京同仁醫(yī)院眼底科現(xiàn)有在職主任醫(yī)師11人，副主任醫(yī)師14人，是國內(nèi)規(guī)模大、綜合實力強的眼底病團隊。團隊骨干擁有各自明確的臨床專長和相關(guān)研究方向，在視網(wǎng)膜脫離、糖尿病視網(wǎng)膜病變、高度近視、黃斑部疾病、眼底腫瘤等多種常見及疑難復(fù)雜眼底病的臨床治 療領(lǐng)域處于國際前沿。