多年來，為方便患者就醫(yī)，醫(yī)院始終堅(jiān)持24小時(shí)接診。醫(yī)院積極踐行公立醫(yī)院改革，推進(jìn)預(yù)約掛號工作，優(yōu)化服務(wù)流程，改善患者就醫(yī)體驗(yàn)，受到國家衛(wèi)生健康委的肯定和廣大群眾的認(rèn)可。醫(yī)院還承擔(dān)了上級部門委派的重大兒童傳染病防治、抗震救災(zāi)支援、突發(fā)公共衛(wèi)生事件救治等醫(yī)療任務(wù)。

腫瘤內(nèi)科科室包括兒童實(shí)體腫瘤、兒童淋巴瘤兩個(gè)專業(yè)，住院部設(shè)置在北京兒童醫(yī)院順義院區(qū)，擁有兩個(gè)病區(qū)，分別收治兒童實(shí)體瘤、淋巴瘤病人。腫瘤內(nèi)科在北京兒童醫(yī)院西城院區(qū)、順義院區(qū)，均設(shè)置有專業(yè)門診，均由專業(yè)醫(yī)生團(tuán)隊(duì)出診，患者可根據(jù)需求選擇不同院區(qū)就診。

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北京兒童醫(yī)院眼科為擁有專業(yè)門診、病房、醫(yī)技檢查、驗(yàn)光配鏡中心、弱視訓(xùn)練、視感知覺工作室為一體的綜合性兒童眼病診療中心，同時(shí)為北京市殘聯(lián)指定殘疾評估、康復(fù)中心，并托管北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院、北京市順義區(qū)婦幼保健院、北京兒童醫(yī)院鄭州醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院新疆醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院黑龍江醫(yī)院。